Лаборатория «Центр геномной биоинформатики им Ф.Г.Добржанского» ежегодно проводит расширенные сессии, на которых сотрудники лаборатории и приглашенные участники рассказывают о своей работе, обмениваются идеями и мнениями. Такие семинары, проводимые обычно дважды в год получили название РЕТРИТ (от анг. retreat).

В этом году участниками ретрита были представители ректората университета, в том числе проректор по науке С.В.Аплонов, первый проректор И.А.Дементьев, а также директор научного парка СПбГУ С.В.Микушев и директор биобанка А.С.Глотов.
Таким образом ретрит стал развернутым представлением для ректората проекта “Российские геномы” и его основных исполнителей. С учетом ограниченности времени представителей ректората презентации были краткими, но содержательными.

Программа семинара-ретрит

Theodosius Dobzhansky Center for Genome Bioinformatics
St. Petersburg State University

9:00AM-1:00PM October 6

• I. Intro, Goals and collecting specimens
  • S.O’Brien Introduction Goals and datasets
  • V.Brukhin Genome Russia samples
• II. Lab protocols+ tracking
  • Anna Gorbunova Lab protocols for specimen processing
  • A.Logachov/A.Shevchenko /I.Evsyukov
• III. Data and IT organization
  • N.Cherkasov IT capacity and needs
  • S.Simonov Websites
  • V.Rotkevich Databases
• IV. Sequencing production and Platform Bake Off
  • D.Polev Peterhof sequencing to date
  • A.Yurchenko Bake-off description , analysis, findings
• V. Analysis for Gene mutation discovery -new and known
  • A.Komissarov Overview of analytical findings
  • S.Kliver QC of sequence and SNV calls
  • S.Sidorov Multi sample alignment and SNV calls
  • K.Krasheninnikova Copy number variation
  • G.Tamazian Known mutations
  • D.Zhernakova Novel mutations
• VI. Natural History
  • P.Dobrynin Population and demographic analysis
• VII. Phenotypes
  • A.Shevchenko GWATCH gene association Application
  • S.Malov Statistics & mutations
  • Katya Chernyaeva TB Russia
• VII. Closing
  • S.OBrien Summation